［ディスクを修復］

起動ディスクには［ディスクを修復］を実行することができません。

Dキー（またはcommand+Rキーを押しながら起動し、ディスクユーティリティを開き、［ディスクを修復］ボタンをクリックします。

Mac OS Xの初期までは、CDなどのメディアを使って起動する必要がありましたが、現在のMacには「復元システム」と呼ばれる起動

• OS X：OS X での復元について - Apple サポート

セーフモード

起動時にsキーshiftキーを押し続けることでセーフブート（セーフモードで起動）されます。ディレクトリの問題の修復を試みたり、不要なキャッシュを削除しますので、たまに行うとよいでしょう。

• OS X：セーフブート、セーフモードとは？ - Apple サポート

ご参考

• 私が月に1度やってるMacのメンテナンス方法 | Stocker.jp / diary
• Macのシャットダウンが遅くなってしまった場合に見直したい項目 – OTTAN.XYZ

起動時のキーの使い分け

• Command + R：HDD領域からのリカバリー
• Command + Option + R：インターネットリカバリー（工場出荷初期状態）

• Option：起動ディスク選択

• OS X YosemiteからダウングレードしてMavericksに戻す方法 | IT Strike

追記（2015年5月5日）：

kingtoshさんからコメントいただきました。

セーフブートは、shift keyですよね Sキーはsingle userブートじゃないですか？

ありがとうございます。修正しました。

「私の環境では、ごっそりファイルを削除すると、ディスクの修復が必要になる ケースが多いです」 ← なんかほかに問題があるような気がします。USBにたくさん機器をぶら下げてるとか。それとも電源がへたり気味とか。

「USBにたくさん機器をぶら下げてる」が該当します。なるほど、それが原因になることがあるのですね！